Lo que sí sabemos es que la primera referencia documental a la existencia de Villarquemado la encontramos fechada el 31 de octubre de 1192 en un documento por el que Lope de Barea deja a Santa María de Perales una heredad en la aldea de “Villar cremado”.
Hasta su disolución, Villarquemado perteneció a la Comunidad de Aldeas de Teruel, integrándose en la sesma del Río Cella. A partir de ese momento pasa a pertenecer sucesivamente en la sobrecullida de Montalbán (1488-1495), a la vereda de Montalbán (1646) y al corregimiento de Teruel (1711-1833). En 1785 pasa de ser considerada aldea a lugar, rango que mantiene hasta 1834, año en el que se constituye como Ayuntamiento, primero del partido judicial de Albarracín y, a partir de 1965 del de Teruel.
Otros núcleos urbanos históricos del término municipal de Villarquemado son los caseríos de El Apeadero, Molino y Venta Pelada, todos ellos de pequeña entidad y deshabitados en la actualidad.